El fons del Museu de lEmpordà, divers i amb peces despecial relleu dins el panorama artístic català, aplega arqueologia, art medieval, modern i contemporani. Des dels seus inicis, lobjectiu prioritari del Museu ha estat enriquir la col·lecció permanent amb obres dart, propòsit aconseguit sobretot a partir de donacions, però també gràcies a dipòsits, cessions, dacions, compres i ajuts a la producció.
En els últims tres anys s'han integrat al fons del Museu prop de quatre-centes peces. L'exposició Noves adquisicions (2019 2021) en mostra una cinquantena, presentades i contextualitzades segons la tipologia d'ingrés.