La CUP ha rebutjat la imputació del president de la Generalitat, Artur Mas; la consellera d'Ensenyament, Irene Rigau, i l'exvicepresidenta del Govern i exconsellera de Governació Joana Ortega, pel procés participatiu del 9-N i ha deixat clar que es tracta "d'un nu atac contra les institucions del país part d'un estat demofòbic que utilitza políticament les instàncies judicials per intentar doblegar la voluntat del poble català". La formació independentista ha alertat que la desobediència viscuda del 9-N serà una "pràctica habitual d'ara endavant per part de les institucions catalanes i més després del mandat clar expressat el passat 27-S a les urnes".
D'altra banda, la CUP ha exigit l'arxivament de la causa contra Mas, Rigau i Ortega perquè han estat imputats "per la seva condició de representants institucionals de Catalunya que complien amb un mandat popular de celebrar un referèndum".
