L'Ajuntament de Castelló d'Empúries ha portat a terme obres de millora al rec del Molí, de manera que en alguns punts s'ha hagut de buidar durant la setmana. L'aigua tornarà a circular en els propers dies, però les obres encara seguiran les properes tres setmanes, aproximadament. El rec dóna aigua a regants des de Peralada a Castelló d'Empúries.

També va ser utilitzat, durant molts anys, per impulsar la maquinària de la farinera, avui reconvertida en museu industrial.